- Aziyadé (1879)
- Rarahu (1880)
- Le Roman d'un spahi (1881)
- Le Mariage de Loti (1882)
- Trois journées de guerre en Annam (1883, souvenirs)
- Mon frère Yves (1883)
- Les Trois dames de la Kasbah (1884)
- Pêcheur d'Islande (1886)
- Madame Chrysanthème (1887)
- La Marchande de sourire (1888, théâtre avec J. Gautier)
- Japoneries d'automne (1889)
- Au Maroc (1890)
- Le roman d'un enfant (1890, autobiographie)
- Le Livre de la pitié et de la mort (1891)
- Fantôme d'Orient (1892, suite d'Aziyadé)
- L'Exilée (1893)
- Le Matelot (1893)
- Le Désert, Jerusalem et La Galilée (1893)
- Ramuntcho (1897)
- Judith Renaudin (1898)
- Reflets de la sombre route (1899)
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- Les Derniers jours de Pékin (1902, souvenirs)
- L'Inde sans les Anglais (1903)
- Vers Ispahan (1904)
- La Troisième jeunesse de Madame Prune (1905)
- Les Désenchantées (1906)
- La Mort de Phila (1909)
- Le Château de la Belle au Bois dormant (1910)
- Un Pélerin d'Angkor (1912)
- La Turquie agonisante (1913)
- La Hyène enragée (1916)
- Quelques aspects du vertige mondial (1917)
- L'Horreur allemande (1918)
- Les Massacres d'Arménie (1918)
- Prime jeunesse (1919)
- La Mort de notre chère France en Orient (1920)
- Suprêmes visions d'Orient (1921)
- Un jeune officier pauvre (1923)
- Lettres à Juliette Adam (1924)
- Journal intime 1878-1881 (1925, première partie)
- Journal intime 1882-1885 (1929, deuxième partie)
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